CDC bekrefter at COVID-19 ble oppdaget i USA allerede i januar

CDC bekrefter at koronavirus ble oppdaget allerede i januar
CDC bekrefter at koronavirus ble oppdaget allerede i januar

Fra 21. januar til 23. februar 2020 oppdaget folkehelsebyråene 14 amerikanske tilfeller av coronavirus sykdom 2019 (COVID-19), alle relatert til reiser fra Kina (1,2). Den første ikke-reiserelaterte amerikanske saken ble bekreftet 26. februar hos en innbygger i California som hadde blitt syk 13. februar (3). To dager senere, 28. februar, ble en annen ikke-reiserelatert sak bekreftet i staten Washington (4,5). Undersøkelse av fire bevislinjer gir innsikt i tidspunktet for introduksjon og tidlig overføring av SARS-CoV-2, viruset som forårsaker COVID-19, til USA før oppdagelsen av disse to tilfellene.

For det første viste syndromisk overvåking basert på akuttmottaksregistreringer fra fylker som ble rammet tidlig av pandemien, ikke en økning i besøk for COVID-19-lignende sykdom før 28. februar. For det andre, tilbakevirkende SARS-CoV-2-testing av omtrent 11,000 1 luftveisprøver fra flere Amerikanske lokasjoner som begynte 20. januar, identifiserte ingen positive resultater før 18. februar. For det tredje antydet analyse av virale RNA-sekvenser fra tidlige tilfeller at en enkelt viruslinje importert direkte eller indirekte fra Kina begynte å sirkulere i USA mellom 9. januar og 2. februar, etterfulgt av av flere SARS-CoV-XNUMX-import fra Europa.

Til slutt, forekomsten av tre tilfeller, en i en innbygger i California som døde 6. februar, en andre i en annen innbygger i samme fylke som døde 17. februar, og en tredje i en uidentifisert passasjer eller mannskap ombord på et stillehavs cruiseskip som dro San Francisco 11. februar bekrefter kryptisk sirkulasjon av viruset innen begynnelsen av februar. Disse dataene indikerer at vedvarende overføring fra samfunnet hadde begynt før oppdagelsen av de to første ikke-reiserelaterte amerikanske tilfellene, sannsynligvis som følge av import av en enkelt viruslinje fra Kina i slutten av januar eller begynnelsen av februar, etterfulgt av flere importer fra Europa. Den utbredte fremveksten av COVID-19 i hele USA etter februar fremhever viktigheten av robuste folkehelsesystemer for å reagere raskt på nye smittsomme trusler.

Syndromisk overvåking

Gjennom National Syndromic Surveillance Program mottar amerikanske folkehelsebyråer sanntidsdata fra beredskapsavdelinger i omtrent 4,000 helsevesen i 47 amerikanske stater og District of Columbia. I 14 fylker med tidlige samfunnskjøpte tilfeller av COVID-19 ble det ikke observert noen betydelig økning i andelen COVID-19-lignende sykdom (feber og hoste eller kortpustethet eller pustevansker, eller oppføring av en koronavirusdiagnostisk kode) før 28. februar.

Overvåking for akutt SARS-CoV-2-infeksjon Seattle influensa-studien (5) begynte å overvåke akutt luftveissykdom i hovedstadsområdet Seattle i november 2018. I slutten av februar 2020 begynte studien å teste prøver med revers transkripsjon – polymerasekjedereaksjon (RT- PCR) -testing for SARS-CoV-2. Det første positive laboratorieresultatet for SARS-CoV-2 ble påvist 28. februar fra en prøve som ble samlet inn 24. februar. Etter denne påvisningen ble deidentifiserte prøver samlet tidligere, retrospektivt testet for virus. Det var ingen positive resultater blant 5,270 luftveisprøver som ble samlet inn fra 1. januar til 20. februar (5) (T. Bedford, Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, Washington, personlig kommunikasjon, 6. mai 2020). Det første eksemplaret som ble testet positivt blant disse retrospektivt testede prøvene, ble samlet 21. februar. I løpet av uken som begynte 21. februar testet åtte av 1,255 prøver (0.6%) positive, og i løpet av uken etter ble 29 av 1,862 (1.6%) prøver testet positivt. To nettverk av influensavaksineeffektivitetsstudier med steder i seks stater (Michigan, Pennsylvania, Tennessee, Texas, Washington og Wisconsin) testet retrospektivt respiratoriske prøver fra pasienter med akutt luftveissykdom for SARS-CoV-2 ved RT-PCR. På Washington-nettstedet testet ingen av de 497 prøvene som ble samlet inn 19. - 24. februar; det første eksemplaret som ble testet positivt ble samlet den 25. februar. På de fem andre stedene (Ann Arbor og Detroit, Michigan; Pittsburgh, Pennsylvania; Temple, Texas; Marshfield, Wisconsin; og Nashville, Tennessee), ble ingen av 2,620 prøver samlet i januar 19. – 29. Februar testet positivt for SARS-CoV-2. Per 22. mai 2020 har fire (<0.2%) av ca 3,000 prøver samlet fra barn og ungdom i alderen <18 år registrert i New Vaccine Surveillance Network † i løpet av 1. januar – 31. mars, testet positive for SARS-CoV-2. Det tidligste positive resultatet var fra en prøve samlet 20. mars i Seattle.

Fylogenetisk analyse

Analyse av det genomiske mangfoldet av SARS-CoV-2 fra tidlige tilfeller av COVID-19 fra Seattle-området viste at de fleste virus tilhørte en enkelt klade (Washington State clade), hvis siste felles forfedre ble anslått å ha eksistert mellom ca. 18. januar og 9. februar (poengestimat = 1. februar) .§ Den antatte genomiske sekvensen til stamfarviruset var i samsvar med det fra det første amerikanske tilfellet av importert COVID-19, som skjedde hos en mann som ankom Seattle fra Wuhan, Kina 15. januar og ble syk 4 dager senere. Imidlertid er det også mulig at Washington-statens klade oppstod fra et virus med en lignende eller identisk sekvens fra en annen person med SARS-CoV-2-infeksjon. Analyse av virus i California og det nordøstlige USA fra februar til midten av mars antydet at det hadde vært flere importer av virus, hovedsakelig fra Europa, etterfulgt av overføring av virus i USA.

Kjente tilfeller hos personer uten relevant reisehistorie

Før 26. februar Det oppstod to bemerkelsesverdige tilfeller av COVID-19 i Santa Clara County, California: en i en kvinne som ble syk 31. januar og døde 6. februar og en annen i en ubeslektet mann som døde hjemme mellom 13. og 17. februar. Ingen av dem hadde reist internasjonalt i ukene før deres død. SARS-CoV-2 RNA ble påvist ved RT-PCR-testing ved CDC fra postmortem vevsprøver fra disse pasientene. Disse dødsfallene ble sertifisert av en lege som COVID-19– tilknyttede dødsfall. Etterforskning av disse sakene pågår. Utbrudd av COVID-19 skjedde under to påfølgende seilaser med et Grand Princess cruiseskip (7). Den genomiske sekvensen av virus fra disse utbruddene var innenfor Washington State-kladen, noe som antydet at en passasjer eller et besetningsmedlem som var smittet med det viruset, var ombord på skipet da det forlot San Francisco havn 11. februar for et tur-retur cruise. Identiteten til den personen er ukjent. Diskusjonsinformasjon fra disse forskjellige datakildene antyder at begrenset samfunnsoverføring av SARS-CoV-2 i USA skjedde mellom siste halvdel av januar og begynnelsen av februar, etter en import av SARS-CoV-2 fra Kina. Denne importen startet en avstamning, Washington State clade, som deretter spredte seg over hovedstadsområdet i Seattle og muligens andre steder. Flere importer av SARS-CoV-2 fra Europa fulgte i februar og mars. Det er ikke kjent hvor mange USA infeksjoner skjedde i løpet av februar og mars, men den totale sykdomsforekomsten før 28. februar var for lav til å kunne oppdages gjennom akuttavdelingens syndromiske overvåkingsdata. Også ukjente er datoene for innførsel av de importerte virusene til USA og identiteten til personene som bar dem. En mulig tidlig kilde er den første rapporterte USA tilfelle av COVID-19, som skjedde i en Washington-mann som ble syk 19. januar etter retur fra Wuhan, Kina, 15. januar; den genomiske sekvensen av viruset som er isolert fra denne mannen, stemmer overens med at han er den mulige kilden til Washington State-kladen, selv om grundigheten av kontaktundersøkelsen i denne saken og fraværet av identifiserte sekundære tilfeller argumenterer mot dette (8). Imidlertid har påfølgende publiserte rapporter antydet at infeksjon med SARS-CoV-2 ofte er asymptomatisk, og at overføring kan forekomme før symptomene begynner (9). Muligheten for presymptomatisk overføring reiser minst tre andre potensielle scenarier som involverer denne saken: 1) at en eller flere sekundære asymptomatiske infeksjoner kan ha oppstått blant pasientens kontakter, og at disse førte til videre, uoppdaget spredning av viruset; 2) at mannen kan ha smittet kontakter før hans symptomdebut (slike kontakter ville ikke blitt identifisert gjennom standard anbefalt kontaktundersøkelse på det tidspunktet); eller 3) at han og minst en annen person ble smittet av en annen passasjer på samme fly fra Wuhan, og uoppdaget spredning fra de andre smittede personene ga opphav til Washington State clade. Hvilke, hvis noen, av disse scenariene som skjedde sannsynlig, vil aldri bli kjent. Det er også mulig, gitt det begrensede globale fylogenetiske mangfoldet av SARS-CoV-2 på den tiden, at Washington State-kladen ble importert til USA av en annen, ukjent person omtrent samtidig. Resultater av serologisk testing presenteres ikke her, fordi serologi (dvs. testing for antistoff mot SARS-CoV-2) sannsynligvis vil være et relativt ufølsomt middel for å oppdage et nylig oppstått virus, spesielt når prøvene ble samlet tilfeldig i stedet for fra personer som mest sannsynlig blir smittet (i motsetning til for eksempel viral testing av polikliniske pasienter eller innlagte pasienter med akutt luftveissykdom) og fordi serologiske analyser vanligvis ikke nærmer seg 100% spesifisitet med mindre en eller annen form for bekreftende testing er tilgjengelig. For eksempel vil en hypotetisk serologisk undersøkelse i hovedstadsområdet i Seattle (befolkning på 3.5 millioner) utført etter de første 3,500 infeksjonene finne en sann seroprevalens på 0.1%, mens bruk av en analyse med 99% spesifisitet forventes å gi falske positive på 10 ganger så mange prøver. Serologiske undersøkelser er likevel nyttige for å spore fremdriften til pandemien en gang etablert, og har den potensielle fordelen av å oppdage alle infeksjoner, uavhengig av symptomprofil. Funnene i denne rapporten er underlagt minst tre begrensninger. For det første er dataene som presenteres her retrospektive. Selv om de er geografisk forskjellige, kan de ikke gi et så definitivt bilde av overføring som det ville være tilgjengelig hvis utbredt testing var umiddelbart tilgjengelig etter oppdagelsen av viruset. For det andre fortsetter noen av de siterte studiene og muligens andre med å teste prøvene med tilbakevirkende kraft og kan finne tidligere tilfeller enn de som er presentert i denne rapporten. Endelig begrenset den relative fylogenetiske homogeniteten til SARS-CoV-2 globalt i januar og begynnelsen av februar det som kan utledes av genomisk analyse. Få land har unngått import og vedvarende spredning av COVID-19. I USA sirkulerer SARS-CoV-2 nå mye etter flere importer fra Kina, Europa og andre steder. Fremgangsmåte er i gang i hele USA offentlig helsesystem for å forbedre indikatorer for SARS-CoV-2-aktivitet, inkludert utvidelse av syndromisk overvåking blant beredskapsavdelinger og øke tilgjengeligheten av testing for SARS-CoV-2. Gitt sannsynligheten for at det meste av USA

#rebuildingtravel

Om forfatteren

Avatar av Chief Assignment Editor

Hovedoppdragsredaktør

Hovedredaktør for oppdrag er Oleg Siziakov

Del til...